돼지 델타코로나바이러스(PDCoV)는 포유자돈에게 설사를 일으키는 신종 코로나 바이러스입니다. 혈청 음성 신생아 자돈에서 심한 설사, 구토, 탈수 및 폐사를 포함한 전형적인 임상 증상을 유발합니다. 이 신종 돼지 코로나바이러스는 2014년 미국에서 처음 발생한 이후 한국을 포함한 전 세계에서 발견되고 있습니다. 그러나 국내에서는 2016년 마지막 보고 이후 최근까지 PDCoV 사례가 보고되지 않았습니다.

2022년 6월 모돈과 자돈이 각각 흑색 설사와 수양성 설사를 보인 한 농장에서 한국형 PDCoV 균주 KPDCoV-2201이 검출되었습니다. 우리는 자돈의 장 샘플에서 'KPDCoV-2201' 균주를 분리하고 바이러스 게놈을 시퀀싱했습니다. 유전적으로 KPDCoV-2201의 전장 게놈과 스파이크 유전자는 다른 글로벌 PDCoV 균주와 각각 96.9-99.2%, 95.8-98.8%의 뉴클레오티드 동일성을 공유했습니다.

계통 발생학적 분석 결과 KPDCoV-2201은 G1b에 속하는 것으로 나타났습니다. 특히 분자 진화 분석 결과, KPDCoV-2201은 이전에 보고된 한국 PDCoV 균주와는 다른 계통에서 진화했으며, 새롭게 출현한 페루 및 대만 PDCoV 균주와 밀접한 관련이 있는 것으로 나타났습니다. 또한, KPDCoV-2201은 S1 영역의 수용체 결합 도메인에서 한 개의 고유한 아미노산 치환과 두 개의 대만 균주와 유사한 아미노산 치환을 가지고 있었습니다.

이번 연구 결과는 바이러스의 국경을 초월한 전파 가능성을 시사하며, 한국 내 PDCoV의 유전적 다양성과 진화에 대한 지식을 넓혀줍니다.

[논문 원문(바로보기), Genetic Characterization and Evolution of Porcine Deltacoronavirus Isolated in South Korea in 2022, 김혜령(경북대학교 수의과대학) 외, Pathogens, 2023] 

번역 및 정리 돼지와사람(pigpeople100@gmail.com)