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돼지생식기호흡기증후군

[초록] 2014-2019년 한국 PRRS 바이러스 ORF5 유전자의 시간적 계통 역학

2014년부터 2019년까지 국내 PRRS 분리주 총 1349건의 ORF5 염기서열 분석...리니지1 증가 추세

돼지생식기호흡기증후군(PRRS) 바이러스는 한국 양돈산업에서 가장 중요한 병원체이다. 차단방역 및 백신 접종 프로토콜 개선 등의 노력에도 불구하고 바이러스는 계속 순환하고 진화하고 있다.

 

ORF5의 계통학적 분석에 따르면, 한국의 PRRS 바이러스는 전 세계적으로 순환하는 리니지(lineage; 계통)뿐만 아니라 국가별 리니지(Lin Kor A, B, C)도 형성하는 것으로 알려져 있다.

 

최근 국내 PRRS 바이러스의 역학 현황을 파악하기 위해 2014년부터 2019년까지 국내 분리주 총 1349건의 ORF5 염기서열을 분석했다. 최대확률법을 이용하여 계통발생학적 분석을 수행하였으며, 계통의 상대적 유병률의 시간적 변화를 조사하였다.

 

분석 결과, 조사 대상 연도 내내 PRRS 바이러스 1형(유럽형)과 PRRS 바이러스 2형(북미형) 모두 높은 유병률을 보였다. PRRS 바이러스 1형 분리주 중 'subgroup A(90.1%)'와 '백신 유사 subgroup C(9.0%)'가 개체군의 대부분을 구성했다. PRRS 바이러스 2형 분리주의 경우, '백신 유사 리니지 5(36.3%)'가 가장 많았고, 이어서 'Lin Kor B(25.9%)', 'Kor C(16.6%)', '리니지 1(11.6%)', 'Kor A(9.1%)'가 그 뒤를 이었다.

 

PRRS 바이러스 2형 '리니지 1'은 서브리니지 1.8(NADC30 유사)의 지속적인 확산과 서브리니지 1.6의 국내 유입으로 인해 2014년 1.8%에서 2019년 29.6%로 증가했다. 비동의어(non synonymous) 및 동의어(synonymous) 돌연변이 분석을 포함한 추가 유전자 분석 결과, 면역학적으로 중요한 유전체 영역에서 다양화 및 양성 선택의 증거가 발견되었다. 이는 현재의 백신 접종이 실패하고 면역 매개 선택을 촉진하고 있음을 시사한다.

 

전반적으로 이러한 연구 결과는 공동 순환(cocirculating) 바이러스 리니지의 역학 및 진화 역학에 대한 통찰력을 제공하며, PRRS바이러스 발생에 대한 지속적인 감시가 필요하다.

 

[논문 원문(바로가기), Temporal lineage dynamics of the ORF5 gene of porcine reproductive and respiratory syndrome virus in Korea in 2014-2019, 김승채(전북대학교 수의과대학) 외, Virology, 2021]

 

 

정리 돼지와사람(pigpeople100@gmail.com)

 

 

 

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